火影忍者手游获取装备及装备升级材料的副本分为冒险精英副本、单人秘境探险、十人团队修罗团本三大核心渠道，搭配副本配套扫荡、组队、积分保底等机制可稳定囤积全品质装备部件，不同副本对应不同养成阶段，合理分配体力与挑战次数能大幅缩短套装成型周期。
冒险精英副本是前期装备养成最基础的副本渠道，通关主线冒险对应关卡后即可解锁对应忍者精英副本，每次挑战消耗10点体力，产出的装备升级材料数量为普通冒险副本两倍，同时附带忍者碎片、铜币等附加资源，适配全等级玩家积累基础装备素材。70级至105级区间扫荡精英副本存在材料双倍收益，该阶段需将每日体力优先投入精英副本扫荡，优先刷取A、B忍对应副本，产出的武器、戒指升级材料供给主力装备提升；105级后可兼顾C忍精英副本补齐头盔、项链、书籍配套材料，无需消耗体力重复刷普通冒险副本。精英副本产出材料等级跟随玩家自身等级浮动，提前囤积的材料不会失效，后续装备进阶时可直接取用，长期坚持扫荡能稳定凑齐六件套基础进阶素材，过渡蓝、紫品质装备完全依靠该副本产出，零氪玩家也能依靠每日体力循环完成基础装备成型。
秘境探险作为单人装备副本，90级通关主线第八章对应关卡解锁，是获取中高品质饰品类装备的专属副本，每日赠送3次免费挑战次数，可消耗金币额外购买2次挑战机会，副本分为普通、修罗两种难度，修罗秘境解锁后橙色传说装备掉落概率翻倍，也是高阶套装饰品的唯一产出渠道。秘境支持双人组队挑战，组队时选择高战力队友担任队长，系统匹配副本难度会适配队伍平均战力，大幅降低通关门槛，同时不削减装备掉落概率。每日前三次免费秘境翻牌存在传说装备保底机制，挑战完成后翻牌优先选择未收集的装备部位，重复的低品质装备可直接分解换取强化精华；秘境挑战券存在七日存储上限，每周需清空存量避免资源浪费，不同主题秘境对应不同属性套装，可根据主力忍者输出属性定向刷取对应秘境，快速凑齐三件套激活套装专属增益效果。
十人团队副本是获取顶级究极忍具装备的核心副本渠道，包含佩恩入侵、忍界大战两大团本，分为普通与修罗模式，仅修罗难度可产出橙色究极套装忍具，普通模式仅掉落蓝、紫色过渡忍具。团队副本每周固定开放挑战次数，通关后积累副本积分，积分达到五百点可稳定保底获取一件究极装备，翻牌环节有概率直接掉落稀有套装部件，组队时建议固定十人组织队伍，分工配置清怪、减防、续航忍者，三分钟内速通副本提升刷取效率。团本产出的陨铁、忍具碎甲等材料可用于装备强化，多余重复忍具可通过忍具合成系统融合，有概率合成全新高阶装备，每周清空团本挑战次数是成型毕业套装的关键，搭配秘境产出的饰品装备，能完整覆盖角色全部装备养成需求。
除三类核心装备副本外，副本配套衍生玩法可进一步补充装备资源，每日完成副本挑战任务会发放扫荡券、体力药剂，扫荡券优先留给修罗秘境与精英副本双倍区间使用；组织内部副本挖矿玩法产出的兑换币，可在组织商店换取副本稀缺装备材料，弥补副本掉落缺失的部件。各类副本产出的闲置装备统一分解，分解获得的精华、玉石可兑换商店限定装备碎片，形成完整的装备资源循环，避免副本掉落资源浪费，新手玩家可按照精英副本打底、秘境补齐饰品、团本刷毕业忍具的顺序规划每日副本挑战，循序渐进完成全套装备养成。
